Từ những năm 2000, bác sĩ Đỗ Đình Hùng lần lượt đảm nhiệm các chức vụ phó khoa, trưởng khoa phục hình và sau đó là Phó giám đốc phụ trách chuyên môn tại Bệnh viện Răng Hàm Mặt Trung ương TP.HCM.

Ông là người chăm sóc sức khỏe răng miệng cho các nhà lãnh đạo cao cấp Việt Nam trong nhiều năm như: Cố Tổng Bí thư Nguyễn Văn Linh, Cố Tổng Bí thư Lê Khả Phiêu, Cố Thủ tướng Phan Văn Khải, Cựu Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng cùng rất nhiều các cán bộ lãnh đạo thuộc các Bộ, ngành Trung ương và các địa phương trên cả nước.

Bác sĩ Đỗ Đình Hùng thuộc nhóm những bác sĩ tiên phong thực hiện cấy ghép implant nha khoa tại Việt Nam vào năm 1994. Ông đặc biệt chuyên sâu nghiên cứu và thực hiện kỹ thuật này với hệ thống Implant Nobel Biocare, sử dụng phần mềm Nobel Guide (sau này là Nobel Clinician) làm máng hướng dẫn phẫu thuật trong cấy ghép implant nha khoa.

Ngay từ năm 2006, ông đã ứng dụng kỹ thuật “All-on-4” của Nobel cho các khách hàng mất răng toàn hàm sau khi tham dự Hội nghị Tích hợp Xương (Academy of Osseointegration – AO) tại Hoa Kỳ và chương trình tập huấn kỹ thuật do Nobel Biocare công bố, hướng dẫn.